Perso, rien ne me choque,
Ton 2000m effectivement est très proche d'un demi cooper (6'). Donc prendre l'allure comme base n'est pas illogique, et donne effectivement 16.3.
Après effectivement, je partage l'opinion que cette vma est légerement sous-estimée, vu que tu l'as faite sur 7'20 plutot que 6', du coup, normal le coup de pompe à la fin. tablez sur 16.5 voir 17 pourrait donc se faire, mais je suis pas sur non plus que le calculateur du site soit prévue pour cela.
En effet, les VMA issues de course plus longue seront aussi influencés par ton degré d'endurance. Difficile à connaitre sans ton entrainement.
Après, ton entraineur est peut etre du coup le mieux placer pour juger de cela non? Disons que le site marche bien dans 2/3 de tes chiffres, et est accord avec ton entraineur. J'irais pas chercher plus loin, et prendrais 16.5 pour simplifier les calculs. Et vois le ressenti au cours des premières séances de VMA.
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